泥鳅MnSOD基因的电子克隆及序列分析
作者: 陈国强 ; 陈忠翔 ; 王萍
摘要:目的:电子克隆并分析泥鳅MnSOD基因。方法:通过电子克隆泥鳅MnSOD基因的开放阅读框,并对其氨基酸组成、功能结构域、系统进化、信号肽、二级结构、三级结构等信息进行预测分析。结果:通过电子克隆获得泥鳅MnSOD基因的cDNA。该基因的开放阅读框大小为675bp,编码224个氨基酸残基,推导的蛋白质分子量为25kDa,等电点约为8.41,其编码序列与其他物种相比非常保守,与鲤形目淡水鱼的MnSOD在进化上亲缘关系最近。其N端含转运肽,推测它定位于线粒体中。预测泥鳅Mn-SOD的二级结构及三级结构含有较多的不规则卷曲和α螺旋,其N端为两个长的反平行螺旋,C端则为含有拧成三股折叠片的α+β结构。结论:该研究为泥鳅进一步的分子生物学及抗氧化研究奠定了基础。
关键字: 泥鳅 MnSOD 电子克隆 序列分析