超级矩阵构树方法研究进展

作者： 朱新宇 [1,2] ; 汪保华 [1]

摘要：在后基因组时代,系统发育重建领域面临许多新的挑战。新的方法正在开发以处理高通量技术产生的庞大而复杂的分子数据。系统发育大树是研究宏观进化和生物学问题的重要手段和基础,组合几百甚至几千个基因的超级矩阵是＂大树＂构建的主要方法之一。与通常的小规模矩阵相比,超级矩阵构树在每个步骤上都面临方法上的挑战,包括取样策略、数据库操作、多序列比对、构树计算和树信心评估等构树环节。文章围绕超级矩阵构树方法的进展、存在的问题和将来的发展进行了简要综述。

关键字： 系统发育    系统发育信息学    超级矩阵    构树      

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